Цирконий накапливается в остаточных дериватах магм (в гранитоидных и щелочных породах) и постмагматических метасоматических образованиях.
Эндогенные месторождения циркония представлены гранитными пегматитами, нефелиновыми сиенитами, альбигитами и карбонатитами, но промышленное значение их как источника циркониевого сырья невелико и минералы циркона (бадделеит, малакон, циртолит, циркон) добываются только попутно с другими полезными компонентами (пирохлором, колумбитом, гатчеттолитом и др.).
Основное промышленное значение имеют россыпи, главным образом прибрежно-морские современные (Австралия, Индия) и древние погребенные и, кроме того, элювиалыю-делювиальные.
Современные морские россыпи приурочены к узкой полосе прибрежных песков, перемываемых прибоем, и протягиваются на сотни километров (Австралия, Индия, Шри-Ланка, США). Циркон и сопровождающие его ильменит, лейкоксен, рутил, монацит, магнетит, иногда касситерит представлены в виде очень мелких окатанных зерен. Содержание шлиховых минералов в песках колеблется от 2—4 до 50%, а в зоне прибоя 90% (Австралия). Колеблется соотношение между минералами титана и циркония. Все прибрежно-морские россыпи циркона комплексные: одновременно с ним добываются ильменит, иногда рутил, монацит, касситерит, а также кварцевый песок, который может использоваться в стекольной промышленности. В ряде месторождений циркон сам является попутным компонентом и извлекается при добыче ильменита.
Древние морские россыпи по геологическому строению, минеральному составу и содержанию полезных компонентов аналогичны современным.
Минералы циркония (циркон, бадделеит) в значительном количестве могут накапливаться и в элювиально-делювиальных россыпях, запасы которых исчисляются миллионами тонн полезных минералов (Бразилия), но имеют второстепенное промышленное значение.
Гафний добывается из циркона, в котором он содержится постоянно в виде незначительной примеси (в среднем около 1 %), и извлекается при химико-металлургическом процессе получения циркония.
