Дальнегорское месторождение бора находится на Дальнем Востоке в районе развития эффузивных и осадочных пород мезозойского и кайнозойского возраста.
Известняки и перекрывающие их песчаники, алевролиты и кремнистые сланцы, относимые к верхнему триасу, прорваны палеогеновыми гранитоидами, а также дорудными и интрарудными дайками диабазовых и андезитовых порфиров. Породы на месторождении формируют асимметричную антиклинальную складку, юго-восточное крыло которой опрокинуто и падает на северо-запад под углом 60—83°. В этом крыле находятся рудные тела.
По известнякам развились датолитоносные геденбергитовые, андрадитовые и волластонитовые скарны. В них же имеется небольшое количество данбурита и аксинита. Там же, где в известняках отмечаются прослои глинистых сланцев, по кремнистым сланцам с прослоями известняков образовались гранат-данбурит-пироксеновые скарны, местами с аксинитом. За счет песчано-сланцевых пород сформировались аксинитсодержащие эпидот-гроссуляровые скарны. Рудные тела имеют линзо- и пластообразную форму. Структуры руд — от мелко- до крупнозернистой, текстуры — пятнистая, полосчатая, брекчиевидная, друзовая.
Генезис месторождения связывают с предполагаемым на глубине массивом гранитоидов.